Pendant l’assemblée générale, vous pourrez participer à 4 ateliers au choix lors de 4 créneaux dédiés. Vous trouverez ci-dessous la description de chaque atelier proposé par créneau.
Précision : Lors d'un même créneau, les trois ateliers se dérouleront en parallèle. Il n'est donc pas possible de participer à plusieurs ateliers d'un même créneau.
Premier créneau : Mercredi 18/03, 13h30 - 15h30
- Atelier de prise en main de l'outil ISIA : gestion des ressources
Animation : Florent Massol, David Ponsard, Vola Rafidiarison (CNRS, CEREEP-Ecotron IleDeFrance)
Descriptif : Au cours de cet atelier, vous serez amenés à découvrir la nouvelle version de l’application ISIA (Information System for Infrastructure Administration) pour la gestion des installations (https://isia.cnrs.fr/). Cette session spécifique sera dédiée à la découverte de l'application et de ses fonctionnalités à travers des travaux pratiques de prise en main du module de gestion de ressources. Il est nécessaire de venir avec un ordinateur portable pouvant se connecter à internet.
- Atelier sur les plans de gestion de données
Animation : Chloé Martin, Sarah Zelman, Sophie Bary, (CNRS, DOHNEE) Christian Pichot (INRAE)
Descriptif : Qu’est-ce qu’un plan de gestion de données ? Quels sont les différents types de PGD (projet, entité) et quels outils utiliser ? Lors de cet atelier, nous aborderons différents questionnements, nécessaires à la rédaction d’un PGD d’une entité de type « installation » : la gestion des échantillons au sein des installations, la traçabilité des contributions des installations et des publications, la gestion des données industrielles et des données personnelles, la charte utilisateur, les différents types de données, leurs processus d’acquisition et leurs formats et enfin le stockage des données. Les sessions seront enregistrées pour permettre la rédaction d’un rapport précisant les pratiques et les points de blocage. Ces discussions permettront de formaliser et de mutualiser les « bonnes pratiques ».
• Atelier de prospective sur l'impact environnemental des installations et des recherches
Animation : Jean-François Le Galliard (CNRS) et Céline Serrano (INRIA, Labos 1point5)
Descriptif : Cet atelier vise à réfléchir à la mesure et aux actions de réduction de l’empreinte environnementale des installations et des projets de recherche, en se basant sur la démarche du collectif Labos 1point5) et les résultats de l’audit interne des installations. L’atelier prendra la forme de restitutions, de discussions et d’enquêtes pour organiser le futur bilan GES de l’infrastructure nationale et lister des actions prioritaires à mettre en œuvre dans nos prochains projets.
Deuxième créneau : Mercredi 18/03, 16h - 18h
• Atelier technique sur l'imagerie du zooplancton
Animation : Carine Puppo (CNRS) et le collectif DAPHNIE (GT Aquatique)
Descriptif : Traditionnellement, le suivi du plancton repose sur des méthodes de pêche et d'analyse microscopique, mais ces approches sont contraignantes. Les récentes avancées en imagerie à haut débit ont permis de surmonter certaines de ces limites. Des systèmes d'imagerie performants, comme le FlowCAM et le ZooScan, facilitent la mesure et la classification des organismes à partir d'échantillons. Cependant, la diminution du nombre d'experts en identification du plancton souligne la nécessité de développer des outils automatisés pour compenser cette perte d'expertise. L’objectif de cet atelier est de réunir les membres qui souhaitent se joindre à un collectif en cours de constitution, dénommé DAPHNIE, dont l’enjeu est de partager l’expertise et développer de nouvelles méthodes en imagerie du zooplancton dans les installations AnaEE France et les laboratoires associés.
• Atelier technique sur la mesure des flux de GES du sol
Animation : Bartoz Zawilski (CNRS, CESBIO, Equipex+ Terraforma)
Descriptif : Il s’agit d’un atelier de présentation et de démonstration pratique des chambres de de mesure à accumulation SAGE (Surface - Air Gas Exchange) du projet Equipex+ Terraforma (https://terra-forma-web.osug.fr/Catalogue-des-instruments). L’atelier sera organisé par le concepteur des chambres avec une présentation introductive des fondements de la technique, la description de la construction des chambres par l’approche DIY et la démonstration des deux types de chambres actuellement proposées dans le catalogue (automatiques et nomades).
• Atelier sur les plans de gestion de données
Identique au premier créneau
Troisième créneau : Jeudi 19/03, 8h30 - 10h30
• Atelier technique sur le bien-être dans les animaleries poissons
Animation : Emilie Réalis (INRAE, CARRTEL)
Descriptif : Cet atelier s’inscrit dans le cadre du projet Aquason du GT Aquatique dont l’objectif est de caractériser, comprendre et réduire les nuisances sonores dans les structures aquatiques utilisées à des fins expérimentales et d’élevage scientifique. Il s’adresse aux scientifiques, responsables de plateformes et gestionnaires de structures aquatiques souhaitant contribuer à une démarche collective et harmonisée à l’échelle nationale. L’atelier débutera par une présentation du contexte scientifique et réglementaire, en particulier des enjeux liés aux environnements acoustiques en systèmes aquatiques confinés et des exigences introduites par la Directive européenne 2024/1262 concernant le contrôle du bruit et des vibrations en animalerie.
Les objectifs, la structuration et la gouvernance du projet AquaSon seront ensuite exposés, ainsi que le rôle du réseau dans la coordination et la mutualisation des actions. Une seconde partie sera consacrée à la présentation du dispositif expérimental du projet. Cette session visera à discuter et valider collectivement un protocole standardisé de mesure acoustique applicable aux différentes structures partenaires, incluant les conditions de mesure, la durée des enregistrements et les configurations techniques étudiées.
Enfin, l’atelier abordera les aspects organisationnels et opérationnels du projet : procédures de désinfection et de circulation du matériel, planification des campagnes de mesures, contraintes spécifiques aux installations, et modalités concrètes d’intégration des structures participantes. Le format présentiel permettra des échanges directs entre représentants des différentes entités et favorisera l’identification de synergies et de contributions complémentaires.
- Atelier technique utilisation de l'IA dans l'expérimentation (équipe Ecotron IDF) : "Comment l’Intelligence Artificielle peut contribuer à l’amélioration de nos structures de recherche : focus sur les ECOTRONS"
Animation : Simon Chollet, Deva Thevaranchan, Michel Tran (CNRS, Ecotron IDF)
- Présenter des cas d'application des bases de la modélisation et de la simulation par IA.
- Introduire l’usage du "deep learning" / IA pour prévoir des réponses des écosystèmes.
- Donner des repères pour appliquer ces méthodes à d’autres projets.
• Atelier de prospective pour les installations in natura: liens entre observations, expérimentations et modélisation dans les dispositifs in natura - comment s’enrichir mutuellement ?
Animation : GT In Natura (Laurence Denaix, Marine Soubeste, Jean-Marc Limousin et Catherine Picon-Cochard)
Descriptif : Certaines installations in natura réalisent des suivis de long terme à partir d’une manipulation d’un ou de plusieurs compartiments environnementaux et recueillent des données sur des chroniques temporelles. Elles ont également vocation à accueillir des expérimentations ponctuelles, qui génèrent de nouvelles données. Les données produites sont utilisées par la modélisation. Cependant, le constat est fait que si les installations fournissent les données et résultats de mesures aux expérimentateurs, ces derniers ne partagent souvent pas les données de leurs expérimentations avec les installations, alors qu’elles pourraient servir à enrichir les dispositifs ou servir à des utilisateurs futurs. Ce constat est également fait pour les modèles, dont les sorties ne sont pas communiquées aux installations. Mais comment collecter et stocker ces nouvelles données ? Les objectifs de l’atelier seront donc de : partager les constats et attentes des différentes communautés (gestionnaires de dispositifs, utilisateurs, modélisateurs) ; identifier les freins et leviers pour renforcer les liens entre observation, expérimentation et modélisation, et faire émerger des pistes de réflexion communes.
Quatrième créneau : Jeudi 19/03, 11h - 13h
• Atelier de prise en main de l'outil ISIA : gestion des projets
Animation : Florent Massol, David Ponsard, Vola Rafidiarison (CNRS, CEREEP-Ecotron IleDeFrance)
Descriptif : Au cours de cet atelier, vous serez amenés à découvrir la nouvelle version de l’application ISIA (Information System for Infrastructure Administration) pour la gestion des installations (https://isia.cnrs.fr/). Cette session spécifique sera dédiée à la découverte de l'application et de ses fonctionnalités à travers des travaux pratiques de prise en main du module de gestion de projets. Il est nécessaire de venir avec un ordinateur portable pouvant se connecter à internet.
• Atelier technique sur la microclimatologie en expérimentation: vers un service de diffusion de données climatique pour l’expérimentation en écologie ?
Animation : Emmanuel Gritti (CNRS, Ecotron de Montpellier)
Descriptif : L’objectif de l’atelier est de discuter la mise en place d’un service de collecte et de diffusions de données climatiques pour les besoins de l’expérimentation en écologie. Il s’agira de recenser les outils et méthodes pour homogénéiser le traitement, la compilation et la restitution des données climatiques (nettoyage, agrégation spatio-temporelle, formatage), avec un accès simplifié via des portails numériques. On discutera aussi la mise à disposition des utilisateurs de conseils et de jeux de données pertinents, adaptés à leurs protocoles expérimentaux et à leurs besoins en recherche. Enfin, on travaillera sur la définition, la caractérisation et la quantification des microclimats, qui est un enjeu majeur aujourd’hui en écologie. Une meilleure compréhension des microclimats permettra de rendre les expérimentations et les modélisations beaucoup plus fiables et pertinentes.
• Atelier prospective sur les approches One Health dans la communauté AnaEE France
Animation : Laurence Denaix et Thierry Caquet (INRAE)
Descriptif : Le concept One Health (pour « une seule santé ») vise à promouvoir une approche pluridisciplinaire et globale des enjeux sanitaires intégrant la santé des humains, celle des animaux et celle de l’environnement. En écologie ou agronomie, les recherches sur une seule santé concernant les épidémies et les zoonoses, les substances toxiques ou l’antibiorésistance par exemple. Dans ce cadre conceptuel global, l’atelier visera à caractériser les recherches en cours sur une seule santé dans l’infrastructure et à identifier les moyens de mobiliser les installations dans le cadre de projets de recherche futurs, par exemple en synergie avec les infrastructures de biologie et santé.
